Buku ini disusun dengan struktur yang sistematis, dimulai dari menyusuri akar berdirinya pesantren sebagai lembaga pendidikan Islam pertama di Nusantara, selanjutnya membahas transformasi pesantren dari konvensional ke modern, serta pendidikan yang mengedepankan aspek zahiri dan batiniyah sebagai fondasi pembangunan karakter santri.
Di bab-bab berikutnya, pembaca diajak untuk memahami klasifikasi pesantren berdasarkan bentuk dan sistem pembelajarannya, yang secara mendalam menguraikan perbedaan sistem kurikulum antara pesantren salafiyah dan khalafiyah.
Selain itu, buku ini mengupas tentang kurikulum formal dan hidden curriculum yang selama ini berjalan di pesantren dan madrasah, termasuk pentingnya manajemen kurikulum yang efektif dan pengembangan kurikulum dengan pendekatan terkini seperti Taba’s Inverted Model.
Bab-bab selanjutnya mengedepankan aspek pendidikan berbasis karakter, mulai dari konsep, strategi pembentukan karakter, hingga implementasi pendidikan karakter di pesantren. Penulis juga mengangkat model-model konkret dari penerapan pendidikan karakter di pesantren, termasuk menggali visi dari tokoh pendidikan Islam seperti KH. Ma’ruf Siddiq.
